六君子汤的药物组成其实很简单，全方由“陈皮一钱，半夏一钱五分，茯苓一钱，甘草一钱，人参一钱，白术一钱五分”等6味中药组成，原方用法是，将这些中药切细，一次使用，煎煮时，可以加生姜三片、大枣二枚，最好是用新汲水（刚刚打上来的井泉水）煎服。对于六君子汤的这个剂量，并不是一天的剂量，而是一次的剂量，现代临床使用时，需要根据实际情况调整剂量。

六君子汤的主要作用是益气健脾、燥湿化痰，主要适用于脾胃气虚兼痰湿证，临床上多以“面色痿白，语声低微，气短乏力，食少便溏，咳嗽痰多色白，恶心呕吐，胸脘痞闷”等症状为主要特征，舌脉上多以“舌质淡、舌苔白腻、脉虚”为主要特征。对于六君子汤的临床妙用，还是清代名医徐大椿直抒胸臆，他认为六君子汤是“补气化痰之剂，为气虚痰湿内聚之专方”，可以说是一语道破天机

六君子汤的君臣佐使，历代医家并没有明说，一般都是说，全方用四君子汤益气补虚、健脾助运，用以治本；用半夏降逆和胃、消痰除满，用陈皮调理气机、燥湿化痰，用以治标。实际上，六君子汤是由它的君臣佐使的配伍特色的，全方以白术为君药，主要起到健脾助运、燥湿化痰的作用；以人参、茯苓为臣药，主要起到补气扶元、渗湿健脾的作用；以半夏、陈皮为佐药，主要起到燥湿化痰、行气和胃的作用；以甘草为使药，主要起到益气和中、调和诸药的作用。

六君子汤虽然只有六味中药，而且是由被誉为“补气第一方”的四君子汤和被誉为“化痰第一方”的二陈汤合二为一的一个奇效良方，它的配伍暗藏着一些鲜为人知的玄机：一方面是全方以益气健脾之药和燥湿化痰之药联合运用，起到“补泻兼施、标本兼治”的作用；另一方面是全方一部分中药甘温补脾，以助运化之功，并杜绝生痰之源，一部分中药燥湿化痰，以除中焦之湿，且辅助脾运之复，两方面相辅相成、相得益彰。这样六味中药，补中寓消，补而不滞，因此以“君子”命名，诚如明代医学家吴昆所说，“名之曰六君子者，表半夏之无毒、陈皮之弗悍，可以与参、苓、术、草比德云耳”。

总体来说，六君子汤所解决的问题，莫过于两大核心，一个是“一切脾胃不健”，另一个是“一切痰湿缠身”，这两种问题，六君子汤都是手到擒来，诚可谓是“脾虚痰湿两相宜”。六君子汤的总体适用范围很广泛，但任何方药，都存在适应证和禁忌证，即便是代表“王道”的六君子汤也概莫能外，对于热毒炽盛、胃热便秘、阴虚以及真阴亏损等患者，则不宜服用六君子汤。